對于土壤的消毒，主要包括藥物消毒法、太陽能消毒法、蒸汽消毒法、水汽消毒法四種，其中應用最為普遍的就是藥物消毒法。對于藥物消毒的方法大家已經相當熟悉，用戶只需要在換茬的空當對土壤進行消毒即可。

其操作步為：

第一，清潔大棚。在上一季的作物收獲之后，要將所有的植株殘體清出溫室大棚，進行深埋或焚燒，從而將大棚內部清理干凈。

第二，將土壤進行深翻，大約30厘米以上的深度，并將大土塊進行拍碎。

第三，撒藥。藥劑的選擇不同，施藥的量和手段也存在差異，用戶可以依據具體的藥物來定。如用濃度為2 % 左右的酒精（用水調和）噴灑在土壤上，然后用塑料薄膜覆蓋1～2星期就可以實現消毒。當然，藥物消毒法也可以與土混合使用，效果也相當不錯。

我們不可否認藥劑消毒給我們帶來了很大的便利，但是藥物的長期使用會大大破壞土壤的結構，造成環境的污染和破壞，土地的生產能力也相應下降。因此，藥物消毒的方法不可長期使用。